Ankhesenpepi II được an táng trong một kim tự tháp thuộc phức hợp kim tự tháp Pepi I của người chồng đầu tiên, là kim tự tháp lớn thứ hai chỉ sau của Pepi I[7]. Hài cốt còn sót lại trên sàn thuộc về một phụ nữ trung niên, có lẽ là của Ankhesenpepi II[8]. Một phần mảnh vỡ của bút tháp tại mộ của bà được tìm thấy, là mảnh vỡ lớn nhất được phát hiện trong thời Cổ vương quốc[7].